Vyrostl ve Winthropu ve státě Massachusetts a získal doktorát v oboru dějin a jazyků zemí Dálného východu na Harvardově univerzitě. V posledních třiceti letech často přispíval do nejvýznamnějších odborných časopisů vycházejících ve Spojených státech a v Japonsku studie mi z oboru moderních a současných japonských dějin. Vyučoval dějiny Japonska na četných amerických a japonských univerzitách, v poslední době na Harvardově univerzitě, a v současnosti je profesorem Fakulty sociálních věd na tokijské univerzitě Hitotsubashi.
Na jaře roku 2001 byl Herbert P. Bix za knihu Hirohito a vznik moderního Japonska vyznamenán Pulitzerovou cenou.